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植物天然產(chǎn)物研究和藥物研發(fā)需要生物學(xué)、化學(xué)、物理學(xué)與藥學(xué)等多個(gè)學(xué)科交叉研究,充滿了未知與挑戰(zhàn)。隨著科研工作的不斷深入,傳統(tǒng)的研究手段逐漸變?yōu)橛蓴?shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的方式,通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬可以加速植物天然產(chǎn)物及其相關(guān)藥物的研發(fā)進(jìn)程,發(fā)掘更深層次的科學(xué)問題。
為此,云南浪潮為中國(guó)科學(xué)院昆明植物所構(gòu)建了一個(gè)集科學(xué)計(jì)算、大數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和智能化管理于一體的多學(xué)科計(jì)算服務(wù)平臺(tái),為植物天然產(chǎn)物挖掘、藥物活性成分探尋、化合物分子精細(xì)建模與優(yōu)化,以及新藥創(chuàng)制等一系列復(fù)雜科研流程注入新的動(dòng)力。
該平臺(tái)通過(guò)整合計(jì)算、存儲(chǔ)、網(wǎng)絡(luò)和應(yīng)用資源,極大地推動(dòng)植物科學(xué)研究的進(jìn)展,實(shí)現(xiàn)科研數(shù)據(jù)的高效管理和分析,加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)新。
加速科學(xué)計(jì)算應(yīng)用運(yùn)行,提升藥物研發(fā)效率。面對(duì)不同科研應(yīng)用的差異化算力需求,以元腦服務(wù)器為核心支撐,實(shí)現(xiàn)各節(jié)點(diǎn)數(shù)據(jù)的高速傳輸,提升了整體算力效率,讓植物天然產(chǎn)物特征分析、分子結(jié)構(gòu)模擬等藥物研發(fā)關(guān)鍵環(huán)節(jié)全面提速。
實(shí)現(xiàn)高速數(shù)據(jù)讀寫,釋放多組學(xué)大數(shù)據(jù)的價(jià)值。為快速處理藥物研發(fā)中產(chǎn)生的高分辨率圖像、大規(guī)模的序列信息和復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)等數(shù)據(jù)信息,平臺(tái)存儲(chǔ)系統(tǒng)可對(duì)接高性能平臺(tái)和私有云平臺(tái),數(shù)據(jù)讀寫效率大幅提升,并顯著降低了數(shù)據(jù)丟失風(fēng)險(xiǎn),有效規(guī)避因數(shù)據(jù)差錯(cuò)導(dǎo)致的項(xiàng)目延誤或失敗。
動(dòng)態(tài)調(diào)整資源配置,讓算力資源物盡其用。為了有效支持各項(xiàng)目組的分子對(duì)接、藥物篩選和藥效預(yù)測(cè)等復(fù)雜計(jì)算任務(wù),滿足差異化需求,算力平臺(tái)實(shí)現(xiàn)資源的統(tǒng)一管理和資源調(diào)度,依據(jù)應(yīng)用特性優(yōu)化資源分配,確保性能極致發(fā)揮。
此外,多學(xué)科計(jì)算服務(wù)平臺(tái)的建設(shè)與應(yīng)用,能夠更好地分析和處理實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),加快新植物天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)速度,幫助昆明植物所的科研人員更準(zhǔn)確地識(shí)別和篩選具有潛在藥用價(jià)值的植物天然產(chǎn)物,從而加速新藥的研發(fā)進(jìn)程。
云南網(wǎng)記者 楊萍 實(shí)習(xí)生 畢筠楚
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